O acervo do Museu Mineiro de São Pedro da Cova começou a ser reunido nos anos 70, depois do encerramento da Companhia das Minas de Carvão de São Pedro da Cova (CMCSPC) e da ocupação dos antigos escritórios desta, pela população local, durante o Verão Quente de 75, dando origem ao Centro Revolucionário Mineiro, onde nasceu, em 1976, o primeiro Museu.
A principal coleção que o Museu recebeu foi então reunida durante o Processo Revolucionário em Curso (PRC), e é composta por objetos e documentação industrial mineira. Esta foi a recolha que serviu de base à instalação do atual Museu Mineiro numa das antigas Casas da Malta adquirida pela Junta de Freguesia à CMCSPC.
O Museu Mineiro, com a exposição da sua coleção e da investigação que dá origem ao programa anual, onde destacamos as exposições temporárias, proporciona ao seu público o contato com uma história de milhões de anos.
A coleção do Museu Mineiro de São Pedro da Cova reúne hoje fósseis animais e vegetais, utensílios e ferramentas utilizados no desmonte, tratamento e expedição de carvão e documentação empresarial da CMCSPC. Tem vindo a crescer qualitativamente através da aquisição e doação de objetos e a ser enriquecida através de património imaterial, conseguido a partir da recolha de testemunhos orais dos antigos trabalhadores mineiros.
Composta por fósseis de trilobites, amonites, peixes e ouriços de vários pontos do Mundo, como China, EUA, Madagáscar, Marrocos, Bélgica, França e Espanha.
Doada pelo colecionador Firmino dos Santos Jesus, do Lugar do Passal, São Pedro da Cova, apaixonado por trilobites e tem viajado nos últimos 30 anos numa aventura em busca de fósseis. A generosidade que lhe é conhecida entre os amigos mais próximos reflete-se na doação da sua coleção privada ao Museu Mineiro de São Pedro da Cova.
Esta coleção pode ser visitada, em exposição permanente da secção geológica do Museu, desde 24 de outubro de 2015.
O Acervo Documental da Companhia das Minas de Carvão de São Pedro da Cova é composto por cerca de 8 000 processos de antigos operários, registos de acidentes de trabalho, doenças profissionais, da Caixa de Previdência do Pessoal, cartões do Sindicato de Mineiros, folhas de salários e pagamentos, registo de sansões disciplinares, mapas de produção, plantas técnicas, topográficas e de exploração, registos de indemnizações e fotografias.
Transitou em 1989 para o atual Museu Mineiro e é composta por utensílios e ferramentas utilizados no desmonte, tratamento e expedição de carvão, maquetes e maquinaria, através dos quais é possível demonstrar e explicar não só a exploração subterrânea de carvão em São Pedro da Cova, mas também os processos de tratamento e expedição.
Esta coleção possui também uma vertente antropológica, retratando a vida das famílias mineiras, com a indumentária e objetos de uso quotidiano.